1- تشکیلات مرکزی سازمان ثبت اسناد و املاک کشور ، در پایتخت مستقر است . معاونت امور املاک و معاونت امور اسناد مهمترین معاونت های سازمان محسوب می شوند که عهده وظایف سازمان در بخش ثبت املاک و ثبت اسناد را بر عهده دارند.   اداره کل امور املاک ، اداره کل نقشه برداری و کاداستر ، اداره کل امور اسناد و سر دفتران ، اداره کل اجرای مفاد اسناد رسمی و و اداره کل ثبت شرکت ها و مالکیت صنعتی نیز از مهمترین ادارات کل سازمان محسوب می شوند که هر یک عهده دار قسمتی از وظایف سازمان هستند .  شورایعالی ثبت با دو شعبه املاک و اسناد و همچنین دادگاه  تجدید نظر انتظامی سردفتران و دفتر یاران نیز در مرکز مستقر هستند .  2- سازمان ثبت املاک و اسناد املاک و اسناد کشور ، نظارت خود را در سطح استانها بواسطه « ادارات کل ثبت استان » اعمال می کند . به تعداد استانهای کشور ( در حال حاضر 30 استان ) و در مرکز هر استان ، یک « اداره کل ثبت استان » که به « اداره کل ثبت منطقه » نیز معروف است مستقر می باشد و بر فعالیت های ثبت محدوده استان مربوطه نظارت می نماید. مانند : « اداره کل ثبت استان تهران » که بر محدوده ثبتی استان تهران نظارت دارد. در هر شهرستان نیز یک « اداره ثبت اسناد و املاک شهرستان » زیر نظر اداره کل ثبت استان مشغول فعالیت است . مانند:« اداره ثبت اسناد و املاک شهرستان شمیرانات » که در محدوده ثبتی شهرستان شمیرانات و زیر نظر اداره کل ثبت استان تهران فعالیت می نماید. در شهرهای بزرگ مثل تهران ، بدلیل حجم وسیع و گستردگی آن ، « ادارات ثبت ناحیه » نیز فعالیت می نمایند. مانند اداره ثبت اسناد واملاک ناحیه های شمال شرق ، شرق، جنوب ، غرب ، شمال غرب و...